张永杰，男，1979年生，博士，教授，博士生导师，入选山西省“三晋英才”支持计划。毕业于中国科学院微生物研究所获微生物学专业博士学位（导师刘杏忠研究员），先后在加拿大麦克马斯特大学（合作导师徐建平教授）和美国加州大学伯克利分校（合作导师John Taylor教授）进修。担任中国菌物学会理事，《Mitochondrial DNA Part B》、《菌物学报》、《菌物研究》和《食用菌学报》编委。兼任生命科学学院国内合作交流工作助理、生物工程系主任、生物工程教研室主任、教工第二党支部书记、生物工程省级一流本科专业负责人等。
一、教学与指导学生情况：
目前，承担本科生的《微生物学》、《新生研讨课》、《毕业论文指导》等课程和研究生的《现代微生物分类学》、《高等真菌资源及利用》、《微生物代谢产物的开发与利用》、《现代生物技术及应用》、《生命科学前沿》等课程的教学工作。曾承担过本科生的《生物制药基础及应用》和研究生的《微生物资源与生态学》课程。
累计指导完成本科生科研训练项目5期共16人次，本科生毕业论文设计共31人次，担任15名本科生的学业导师。
2009年起受聘硕士生导师，2019年起受聘博士生导师，累计指导研究生共34人，已毕业24人。培养的研究生中多人次获国家奖学金（4人）、校优秀研究生（13人）、校优秀毕业研究生（3人）、校优秀学位论文（2人）等荣誉。
本研究团队（包括教授1名、副教授1名）招收研究生的专业：
博士：微生物学
学硕：微生物学
专硕：农业领域（含资源利用与植物保护、食品加工与安全两个专业方向）
本团队长期招收研究生，欢迎报考！
二、研究兴趣：
进化生物学（Evolutionary Biology）作为生物学的一个分支，是研究生物进化的学科，进化的过程、原因、机制和趋势都属于进化生物学的研究范畴。生物界许多复杂现象，如生物的适应、物种形成、物种灭绝及分子进化，都需要在进化生物学的研究中解析内部机制和原因。近二十年来，进化生物学经历了一个快速发展和变革的时期，已成为生命科学领域发展最为迅速的分支学科之一。随着微生物生理学和基因组学的快速发展，以及微生物本身具有繁殖周期短的特性，微生物成为研究生物进化的理想材料。
本课题组主要利用现代组学技术（基因组学、转录组学、比较基因组学、群体基因组学、宏基因组学等）开展微生物进化生物学的研究。主要研究领域包括：1）真菌群体遗传与进化：利用多基因序列分析技术和组学手段研究重要真菌的群体遗传学，探究其物种分化水平、群体遗传结构、演化历程、谱系地理学等；2）真菌线粒体基因组学：组装重要真菌的线粒体基因组，通过种内和种间水平的比较寻找真菌线粒体DNA的进化规律，筛选重要真菌的线粒体遗传标记；3）特殊食品微生物组与食品安全：利用DNA高通量测序、质谱技术等研究特殊食品（如茶叶、中药材、传统发酵食品）中的微生物群落结构及功能，鉴别功能微生物种类，为食品安全使用提供依据。4）微生物资源开发利用：收集和保藏微生物资源，研究其生物活性，筛选具有利用价值的微生物资源。本课题组瞄准微生物进化与利用的核心科学问题，将澄清一些重要微生物的进化历程，丰富和发展微生物进化理论体系，为珍稀真菌资源的保护及有益微生物的合理利用提供理论依据。
三、科研成果：
截至目前，本课题组已在国内外学术期刊上累计发表论文90余篇（被引近2400+次，h-index 27），其中在Mol Ecol、Environ Microbiol、Int J Mol Sci等国际刊物发表SCI论文51篇（总影响因子约140；含高水平论文20篇）。主编或参编著作6部；授权发明专利2项；获世界虫草论坛“青年研究创新奖”特等奖、山西省自然科学奖二等奖（第一完成人）、山西省高等学校优秀成果奖、中国精品科技期刊顶尖学术论文等奖励。
1. Zhang Y.J.*, Fan X.P., Li J.N., Zhang S*. Mitochondrial genome of Cordyceps blackwelliae: organization, transcription, and evolutionary insights into Cordyceps. IMA Fungus, 2023, 14:13 (IF=8.044; SCI 1区)
2. Zhang S., Wang S., Fang Z.M.*, Lang B.F.*, Zhang Y.J*. Characterization of the mitogenome of Gongronella sp. w5 reveals substantial variation in Mucoromycota. Applied Microbiology and Biotechnology, 2022, 106:2587–2601 (IF=4.813; SCI 2区)
3. Ren L.Y., Zhang S.*, Zhang Y.J.* Comparative mitogenomics of fungal species in Stachybotryaceae provides evolutionary insights into Hypocreales. International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22(24):13341 (IF=5.923; SCI 2区)
4. Zhang S., Bai X., Ren L.Y., Sun H.H., Tang H.P., Vaario L.M.*, Xu J.P.*, Zhang Y.J*. Dynamic evolution of eukaryotic mitochondrial and nuclear genomes: a case study in the gourmet pine mushroom Tricholoma matsutake. Environmental Microbiology, 2021, 23(11):7214–7230 (IF=5.491; SCI 2区)
5. Fan W.W., Zhang S.*, Zhang Y.J*. The complete mitochondrial genome of the Chan-hua fungus Isaria cicadae: a tale of intron evolution in Cordycipitaceae. Environmental Microbiology, 2019, 21(2):864-879 (IF=5.395；SCI 2区)
6. Zhang S., Zhang Y.J.*. Proposal of a new nomenclature for introns in protein-coding genes in fungal mitogenomes. IMA Fungus, 2019, 10:15 (IF=4.5；SCI 2区)
7. Nie Y.#, Wang L.#, Cai Y., Tao W., Zhang Y.J.*, Huang B*. Mitochondrial genome of the entomophthoroid fungus Conidiobolus heterosporus provides insights into evolution of basal fungi. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103(9):1379–1391 (IF=3.34; SCI 2区)
8. Zhang S.*, Zhang Y.J.*, Li Z.L. Complete mitogenome of the entomopathogenic fungus Sporothrix insectorum RCEF 264 and comparative mitogenomics in Ophiostomatales. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103(14):5797-5809 (IF=3.34; SCI 2区)
9. Wang L., Zhang S., Li J.H.*, Zhang Y.J.*. Mitochondrial genome, comparative analysis and evolutionary insights into the entomopathogenic fungus Hirsutella thompsonii. Environmental Microbiology, 2018, 20(9): 3393-3405 (IF=5.395; SCI 2区)
10. Sandor S., Zhang Y.J., Xu J.P*. Fungal mitochondrial genomes and genetic polymorphisms. Applied Microbiology and Biotechnology, 2018, 102: 9433-9448. (IF=3.34; SCI 2区)
11. Zhang S., Hao A.J., Zhao Y.X., Zhang X.Y., Zhang Y.J.* Comparative mitochondrial genomics toward exploring molecular markers in the medicinal fungus Cordyceps militaris. Scientific Reports, 2017, 7: 40219 (IF=5.228; SCI 2区).
12. Zhang Y.J.*, Yang X.Q., Zhang S., Humber R.A., Xu J.P.* Genomic analyses reveal low mitochondrial and high nuclear diversity in the cyclosporin-producing fungus Tolypocladium inflatum. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(23): 8517-8531. (IF=3.34; SCI 2区)
13. Zhang Y.J.*, Zhang H.Y., Liu X.Z., Zhang S*. Mitochondrial genome of the nematode endoparasitic fungus Hirsutella vermicola reveals a high level of synteny in the family Ophiocordycipitaceae. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(8): 3295-3304 (IF=3.34; SCI 2区).
14. Zhang S., Wang X.N., Zhang X.L., Liu X.Z., Zhang Y.J.* Complete mitochondrial genome of the endophytic fungus Pestalotiopsis fici: features and evolution. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(4): 1593–1604 (IF=3.34; SCI 2区).
15. Zhang Y.J.*, Hou J.X., Zhang S., Hausner G., Liu X.Z.*, Li W.J. The intronic minisatellite OsMin1 within a serine protease gene in the Chinese caterpillar fungus Ophiocordyceps sinensis. Applied Microbiology and Biotechnology, 2016, 100(8): 3599-3610 (IF=3.34; SCI 2区)
16. Zhang Y.J., Zhang S., Li Y.L., Ma S.L., Wang C.S., Xiang M.C., Liu X., An Z.Q., Xu J.P.*, Liu X.Z.* Phylogeography and evolution of a fungal-insect association on the Tibetan Plateau. Molecular Ecology, 2014, 23(21): 5337-5355. (IF=6.494; SCI 2区)
17. Zhang S.#, Zhang Y.J.#, Liu X.Z.*, Zhang H., Liu D.S. On the reliability of DNA sequences of Ophiocordyceps sinensis in public databases. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 2013, 40: 365-378 (IF=2.505; SCI 2区).
18. Sun X.Y.#, Kang S. #, Zhang Y.J. #, Tan X.Q., Yu Y.F., He H.Y., Zhang X.Y., Liu Y.F., Wang S., Sun W.X., Cai L., Li S.J.* Genetic diversity and population structure of rice pathogen Ustilaginoidea virens in China. PLOS ONE, 2013, 8(9): e76879 (IF=3.534; SCI 2区)
19. Zhang Y.J., Bai F.R., Zhang S., Liu X.Z*. Determining novel molecular markers in the Chinese caterpillar fungus Ophiocordyceps sinensis by screening a shotgun genomic library. Applied Microbiology and Biotechnology, 2012, 95: 1243-1251 (IF=3.689; SCI 2区)
更多文章详见：https://www.researchgate.net/profile/Yong_Jie_Zhang/research
1. 张永杰. 真菌线粒体基因组的进化. 见：真菌进化生物学. 北京：科学出版社，2022，158-172
2. Zhang Y.J., Xu J.P. Molecular Mechanisms of Fungal Adaptive Evolution, In: P.H. Rampelotto (Ed.), Molecular Mechanisms of Microbial Evolution, Springer, Cham, Switzerland, 2018, pp. 409-435
3. 张永杰，刘杏忠. 虫生真菌的进化生物学研究. 见：世界虫草论坛：2011~2017. 北京：科学出版社，2018，46-48.
4. 张永杰. 冬虫夏草菌的生物学研究. 北京：科学出版社，2012
1. 张永杰，张姝，任丽媛，孙慧慧. 一种松茸的真伪鉴别方法，2022，中国发明专利，ZL 2021 1 0542865.0
四、科研项目:
先后承担科研项目30项，其中省部级以上22项。主要科研项目如下:
1. 国家自然科学基金：早期分化真菌的线粒体基因组进化与系统发育研究（32370014），2024
2. 国家自然科学基金：蛹虫草线粒体DNA的遗传多样性与线粒体遗传机制的研究（31872162），2019
3. 国家自然科学基金：通过多基因序列分析研究冬虫夏草菌与寄主昆虫的协同进化（31140013），2012
4. 国家自然科学基金：冬虫夏草的真菌群落结构及对真菌资源开发潜力的评价（81102759），2012
5. 教育部高等学校博士学科点专项科研基金：名贵药材冬虫夏草真菌群落研究（20101401120007），2011
6.山西省高等学校优秀成果奖培育项目：虫草资源可持续利用的基础研究 （2020KJ030），2020
7. 山西省回国留学人员科研资助项目：基于线粒体基因组的虫草类真菌的系统进化研究（2017-015），2017
8. 山西省自然科学基金：山西省虫草资源调查及其虫草菌的研究 （201601D011065），2016
9. 山西省留学回国人员科技活动择优资助项目：参与普洱茶后发酵生产的关键微生物物种的鉴别，2016
10. 真菌学国家重点实验室开放课题：冬虫夏草菌的线粒体基因组测序及比较线粒体基因组学研究，2013
五、教改项目：
1. 山西省高等学校教学改革创新项目：生物科学与生物工程类专业本科教学模式改革与创新（Z2021006），2021
2. 山西大学生命科学学院教材建设培育项目：设备及工艺生产实习指导（JXCGPY2021121414），2021
六、获奖与荣誉:
2021年：山西省自然科学奖二等奖，第1完成人
2021年：《菌物学报》优秀编委
2020年：山西省高等学校优秀成果奖二等奖，第1完成人
2019年：入选山西省“三晋英才”支持计划
2018年：中国精品科技期刊顶尖学术论文（F5000）
2017年：世界虫草论坛“青年研究创新奖”特等奖
2016年：东莞市科学技术奖一等奖，第10完成人
2016年：山西大学优秀硕士学位论文指导教师
2013年：西藏自治区科学技术奖三等奖，第2完成人
联系方式:
E-mail: zhangyj2008@sxu.edu.cn
地 址：山西省太原市小店区南中环东街63号 山西大学（东山校区）生命科学学院
邮 编：030031